Профілактика кокцидіозу свиней полягає у виконанні наступних правил:
- створення сприятливих санітарно-гігієнічних умов утримання тварин: своєчасна заміна підстилу, очищення свинарника від випорожнень тварин, обмивання тварин мильними розчинами, підтримання оптимальної вологості, температури у свинарнику.
- повноцінне та достатнє харчування тварин;
- згодовування свиноматці за 7-10 днів до опоросу профілактичних препаратів (монензин 0,1 кг на тонну корму, ампроліум 1 кг на тонну корму) з повторенням кожні 2 тижні;
- не допускають скупченість тварин, поділяють молодняк та дорослих особин;
- підлоги, годівниці та предмети догляду періодично обробляти вогнем паяльної лампи.
- у неблагополучних із захворювання сільськогосподарських угіддях проводять хіміопрофілактику кокцидіозу, для цього двічі протягом 5 днів з інтервалом два тижні свиноматкам дають бровітакокцид, дитревіт, тримеразин.